モンゴル科学アカデミー古生物学研究所と協力し、モンゴルのゴビ砂漠から発掘される恐竜を含む脊椎動物化石の発掘作業を実施しています。この他、国内外の骨格化石やアンモナイトなどの無脊椎動物化石、植物化石などを、学生が観察、分析しています。

講義では、標本を活用して、生物の進化や化石の研究方法について幅広く学び、様々な化石の形や産出状況、過去の環境や地質時代について知識を広げます。さらに、標本展示の仕方などについても学び、考えます。自然史系の博物館などの見学実習では、展示だけでなくバックヤード（標本庫や管理室など）も見学し、標本の管理についても学びます。

化石標本は、産出場所やその地質時代をデータとして書き込み、一つ一つ標本番号を付けて整理します。必要な場合は、化石に対してクリーニング作業やレプリカ作製といった化石プレパレーションを行い、研究などに使用します。貴重な化石を扱うには地道で慎重な作業が求められます。授業や実習、卒業研究を通して、そのノウハウを学んでいきます。

化石は地層から発見されるため、地層そのものについても学習します。野外で地層を観察し、地層のでき方を学ぶことで、産出する化石動植物の生息した古環境を復元する手法を学びます。また化石と地層を学習することで、化石が見つかりやすい地層に関する研究も行います。